Исследователи из Юго-западного медицинского центра UT выявили сотни новых генетических вариантов в группе из 195 семей с разнообразными предками. В исследовании приняли участие 222 человека с расстройствами аутистического спектра (РАС), что значительно расширило каталог известных мутаций, связанных с этим заболеванием. Уникальные варианты, обнаруженные в ходе исследования, ранее не были зарегистрированы в общедоступных геномных базах данных и не встречались ни у одного другого человека в исследуемой когорте.
Результаты исследования опубликованы в журнале npj Genomic Medicine. В ходе работы ученые обнаружили потенциально патогенные варианты, которые могут увеличить риск развития аутизма, в 73 известных генах РАС или расстройств нервного развития. Эти варианты были выявлены у 69 человек с РАС. Кроме того, команда выявила потенциально патогенные варианты в 120 новых генах-кандидатах, требующих дальнейших исследований для подтверждения их роли в развитии РАС.
«Исследования показывают, что с предрасположенностью к РАС может быть связано до 1000 генов, и генетические варианты, выявленные на сегодняшний день, представляют собой лишь часть бремени болезни», — отметила Мария Чахрур, научный сотрудник Юджина МакДермотта в Центре роста и развития человека и Центре генетики защиты хозяина, неврологии и психиатрии.
«Нам предстоит пройти долгий путь, чтобы полностью понять конкретные генетические причины РАС, но исследования, подобные этому, расширяют наши знания. Они позволяют нам уточнить будущие исследования и в конечном итоге могут привести к разработке таргетной терапии», — добавила Чахрур.
Для идентификации мутаций и вариантов исследователи использовали метод изучения редких генетических заболеваний, называемый секвенированием всего экзома. Этот процесс включает анализ кодирующих белок областей генов в геноме, известных как экзомы, которые составляют около 1% генома. Однако они содержат 85% известных вариантов, связанных с заболеванием.
Секвенирование всего экзома является более быстрым и дешевым методом по сравнению с секвенированием всего генома. Для получения ДНК использовались образцы крови, слюны или мазков из щек. Секвенирование было выполнено в сотрудничестве с Центром генетики Regeneron.
Исследование основано на предыдущей работе Юго-западного университета Юта по изучению генетической основы РАС в различных группах населения. В частности, были проведены новаторские исследования когорты лиц восточноафриканского происхождения, у которых распространенность этого заболевания выше, чем у других групп населения. Семьи, включенные в текущее исследование, были в основном из района Даллас-Форт-Уэрт и включали пациентов из Детского медицинского центра Далласа. В исследовании участвовали представители афроамериканского, азиатского, латиноамериканского, ближневосточного, индейского и европейского происхождения.
«Сосредоточение внимания на разнообразной когорте, состоящей из нескольких предков, как это было сделано в этом последнем исследовании, помогает выявить эффекты, специфичные для предков, и улучшить интерпретацию данных клинического генетического тестирования», — отметил доктор Чахрур, научный сотрудник Института мозга Питера О’Доннелла-младшего.
«В прошлом исследования генетики РАС были сосредоточены почти исключительно на популяциях европейского происхождения. Наша цель — расширить генетический ландшафт РАС за счет включения нескольких предков, особенно тех, которые недостаточно представлены», — заключает Чахрур.
Литература:
Ashlesha Gogate et al, The genetic landscape of autism spectrum disorder in an ancestrally diverse cohort, npj Genomic Medicine (2024). DOI: 10.1038/s41525-024-00444-6
Ведущий специалист отдела организации клинических исследований, терапевт, врач ультразвуковой диагностики АО «СЗМЦ» (г. Санкт-Петербург), главный редактор, учредитель сетевого издания Medical Insider, а также автор статей
E-mail для связи – [email protected];
