Анализ крови может различить бактериальную и вирусную инфекцию

Исследователи медицинского факультета Стэнфордского университета (Stanford University) сделали важный прорыв в разработке диагностического метода, который может показать, какая инфекция у пациента и будет ли польза от антибиотиков. Результаты исследования опубликованы в журнале Science Translational Medicine.

антибиотики, Science Translational Medicine
(с) C. Bickel / Science Translational Medicine

Антибиотики спасли много миллионов жизней. Но чрезмерное их использование угрожает создать устойчивость к антибиотикам. Из-за этой проблемы эксперты в области здравоохранения регулярно напоминают врачам назначать антибиотики только при бактериальных инфекциях. Но часто нет простого способа, чтобы определить, является болезнь бактериальной или вирусной.

“Зачастую вы не можете точно сказать, какого рода инфекция”, – сказал Тимоти Суини (Timothy Sweeney), ведущий автор статьи. “Бактериальная и вирусная инфекция часто выглядят одинаково”.

“Идея найти диагностический метод пришла из предыдущих работ” – сказал соавтор исследования Пурвеш Кхатри (Purvesh Khatri). “В этой работе мы нашли ответ иммунной системы человека к нескольким вирусам, которые отличаются от бактериальных инфекций. Мы решили выяснить, можно ли использовать эту разницу, чтобы улучшить диагностику бактериальных и вирусных инфекций “.

Ученые использовали общедоступные данные экспрессии генов пациента, чтобы точно определить семь человеческих генов, активность которых изменяется во время инфекции. Их структура активности может различать, является ли инфекция бактериальной или вирусной.

Тест семи генов представляет собой шаг вперед по сравнению с предыдущими тестами, которые рассматривали активность сотен генов. Так как в тест вовлечено мало генов, то он будет дешевле, проводится быстрее и при этом остается точным.

Исследование, проведенное в Непале Джейсоном Эндрюс (Jason Andrews) показало, что только 5% пациентов, получавших антибиотики, на самом деле нуждались в них. Непальские больные получали антибиотики, потому что они были дешевле.

“Если мы действительно хотим изменить ситуацию”, – сказал Кхатри, “наш тест должен быть более рентабельным, чем сам препарат”. 

Сегодня лекарственно-устойчивые бактерии вызывают 2 миллиона заболеваний и 23000 смертей ежегодно только в Соединенных Штатах. Помимо содействия эволюции резистентных микробов, антибиотики повышают риск развития побочных эффектов, таких как разрыв сухожилия или повреждение почек, они также могут повредить кишечник и вызвать нарушение микробиомы, что  имеет большое значение для общего состояния здоровья.

Новый метод, направленный на экспрессию генов для бактериальной инфекции, сталкивается с двумя препятствиями, прежде чем будет доступен для врачей. Во-первых, он должен быть тщательно проверен в клинических условиях. Исследователи проверяли тест семи генов на образцах крови 96 тяжелобольных детей с использованием анализа под названием NanoString. Они обнаружили, что тест был точен. Но необходимо провести дополнительные подтверждения на большем количестве образцов крови пациентов.

Во-вторых, тест должен быть встроен в устройство, которое может дать результат в течение часа. В предварительной версии NanoString анализ крови занимает от четырех до шести часов – это слишком долго для людей, которые серьезно больны. У пациентов с сепсисом, например, риск смерти увеличивается на 6 – 8 % за каждый час.

Часто пациенты имеют ранние бактериальные инфекции, и врачи до сих пор не понимают, что пациент находится в опасности. Тест экспрессии генов может убрать сомнения и позволит врачам раньше назначать антибиотики и спасти жизнь.

Авторы другого исследования заявляют, что анализ крови поможет выявлять рубцовые изменения печени на ранних стадиях.


Подробнее в научной статье:

Sweeney T Wong H Khatri P Ferrer R Martin-Loeches I et. al. Robust classification of bacterial and viral infections via integrated host gene expression diagnostics // Science translational medicine – 2016 – vol: 8 (346) – pp: 346ra91

антибиотики, Science Translational Medicine
(с) American Association for the Advancement of Science