Исследователи разработали новый метод, который позволяет одновременно отслеживать распространение нескольких супербактерий в больнице. Это может помочь предотвратить и контролировать больничные инфекции быстрее и эффективнее.
Новая техника геномного анализа помогает предотвращать больничные инфекции
Исследование, опубликованное в журнале Lancet Microbe, проводилось Университетом Осло (University of Oslo). В нём описывается новый подход к глубокому секвенированию, который позволяет фиксировать все распространённые инфекционные бактерии в больнице.
Современные методы культивируют и секвенируют все патогены отдельно, что требует больше времени и усилий. Новый подход позволяет одновременно собирать данные секвенирования всего генома нескольких патогенов. Это позволяет получить геномные данные так же быстро, как больницы могут обработать образцы.
Команда взяла образцы у 256 пациентов в итальянской больнице и обнаружила, что пациенты в отделениях интенсивной терапии были колонизированы по крайней мере одной бактерией, способной вызвать тяжёлое заболевание в любое время. Также было обнаружено, что клинически важные гены AMR (антимикробной резистентности) присутствовали как минимум в 40% из них.
Профессор Юкка Корандер (Jukka Corander), соавтор исследования из Института Уэллкома Сэнгера () и Университета Осло, сказал, что этот метод потенциально может изменить геномный надзор за патогенами: «Наш метод позволяет захватывать важную информацию быстрее и полнее, чем когда-либо прежде, без потери разрешения».
Доктор Гарри Торп (Harry Thorpe), первый автор исследования из Университета Осло, считает, что этот подход может быть использован в будущих исследованиях для выявления всего спектра бактерий высокого риска в определённых областях и, будем надеяться, в больницах. Это поможет отслеживать и ограничивать распространение устойчивых к лечению бактерий.
Профессор Фаусто Бальданти (Fausto Baldanti) отметил, что исследование показало, что супербактерии не исчезли, несмотря на усилия по борьбе с пандемией COVID-19. Он также подчеркнул, что одновременное присутствие нескольких видов лекарственно-устойчивых бактерий в отделениях интенсивной терапии могло быть важным компонентом клинического проявления нового заболевания в те драматические дни.
Профессор Николас Томсон (Nicholas Thomson), со-старший автор исследования считает, что интеграция этого подхода в системы здравоохранения даёт медицинским работникам новую возможность видеть и отслеживать бактерии, помогая в диагностике инфекций и позволяя выявлять вспышки.
Литература:
Pan-pathogen deep sequencing of nosocomial bacterial pathogens during the early COVID-19 pandemic, spring 2020: A prospective cohort study, The Lancet Microbe (2024). DOI: 10.1016/S2666-5247(24)00113-7
Ведущий специалист отдела организации клинических исследований, терапевт, врач ультразвуковой диагностики АО «СЗМЦ» (г. Санкт-Петербург), главный редактор, учредитель сетевого издания Medical Insider, а также автор статей
E-mail для связи – [email protected];
