Рак желудка (РЖ) остается одной из самых смертоносных форм злокачественных опухолей, распространенной в Восточной Азии, Восточной Европе и Южной Америке. РЖ является основной причиной смерти от рака у мужчин. Основная проблема заключается в том, что болезнь часто диагностируется на поздних стадиях, когда выживаемость составляет менее 10%. В то же время, раннее обнаружение РЖ может спасти до 90% жизней. В поисках новых методов ранней диагностики мы обратили внимание на «прыгающие гены» (TEs) – мобильные элементы генома.
TEs: Забытые герои генома
Геном человека состоит из примерно 3 миллиардов оснований, из которых только 1% кодирует белки. Остальные 50% – это TEs, способные к репликации и перемещению в геноме. Первоначально они были названы «мусорной ДНК» за свою паразитическую природу, но исследования Барбары Макклинток показали их важную роль в регуляции генов. Сегодня TEs признаны ключевыми регуляторами как в здоровых, так и в больных клетках.
TEs и рак желудка
В своем исследовании ученые использовали данные секвенирования одноклеточной РНК для реконструкции эволюции клеток от нормального состояния к злокачественному. Исследователи обнаружили, что активация TEs связана с «опухолевыми» клеточными линиями. Для подтверждения этих результатов я провел анализ данных секвенирования РНК с пространственным разрешением, который показал, что TEs активируются как в опухолевых тканях, так и в их микроокружении.
Заключение
Эти результаты указывают на то, что TEs могут служить новыми биомаркерами для раннего обнаружения рака желудка. Следующим шагом будет экспериментальная проверка этих выводов, что может привести к разработке новых методов лечения и диагностики РЖ.
Литература
Braulio Valdebenito-Maturana, The spatial and cellular portrait of transposable element expression during gastric cancer, Scientific Reports (2024). DOI: 10.1038/s41598-024-73744-7
Руководитель Отдела организации клинических исследований, врач-онколог, уролог в АО «СЗЦДМ» (г. Санкт-Петербург), редактор и автор статей
