Ученые исследовали влияние иммунотерапии на иммунную систему и опухоли

В результате исследовательского сотрудничества под руководством доктора медицинских наук Тимоти Чана (Timothy Chan) и компании Bristol Myers Squibb был опубликован обзор того, как иммунная система влияет на архитектуру опухоли при иммунотерапии. Исследование, опубликованное в журнале Nature Medicine, показало, как иммунотерапия рака вызывает распознавание опухоли с помощью неоантигенов и изменяет её экосистему.

Исследование включало восьмилетнее наблюдение за пациентами, у которых были взяты образцы опухолей до и после начала иммунотерапии. Целью было понять, как иммунная система распознаёт и изменяет опухоли в ответ на лечение.

Иммунные и раковые клетки постоянно взаимодействуют, влияя друг на друга в ходе рака. Иммунотерапевтические методы лечения должны учитывать это взаимодействие, стимулируя иммунные клетки для устранения рака.

Неоантигены — это небольшие пептиды, образующиеся из мутировавших раковых клеток. Они являются основным маркером для иммунной системы, позволяющим распознавать опухоль как чужеродную.

Испытание CheckMate-153 проводилось фармацевтической компанией Bristol Myers Squibb, а команда доктора Чана играла центральную роль в анализе данных. В рамках исследования было проведено дополнительное исследование биомаркеров для определения влияния неоантигенов на реакцию на ниволумаб.

Для решения проблемы неточных инструментов прогнозирования неоантигенов команда разработала самый крупный скрининг, подтвердив свои прогнозы и отслеживая динамическую реакцию на лечение.

В течение трёх недель лечения у пациентов, хорошо реагировавших на ниволумаб, наблюдалось снижение количества клональных неоантигенов. У пациентов без ремиссии иммунологический ответ был менее выражен, но на меньшие популяции неоантигенов.

Современные инструменты прогнозирования неоантигенов в значительной степени полагаются на HLA-связывающие неоантигены, но не учитывают аспект иммуногенности, распознаваемый Т-клетками. Команда разработала программу машинного обучения для лучшего прогнозирования иммуногенных неоантигенов, выявив новые свойства раковых неоантигенов.

Ученые отметили, что каждая Т-клетка распознаёт отдельный неоантиген, что изменяет клональный состав опухоли. Это наблюдение бросает вызов преобладающей теории, согласно которой опухоли нужна только одна мутация для развития признаков, воспринимаемых иммунной системой как угроза. Результаты показывают, что для хорошего ответа на лечение необходимо множество различных Т-клеток, распознающих различные раковые особенности.

Каталогизация изменений в неоантигенах во время лечения будет иметь решающее значение для будущих исследований в области иммуноонкологии. Доктор Чен подчеркнул, что изучение реакции иммунной системы на раковые мутации является Святым Граалем для исследователей иммунотерапии, и результаты исследования приближают нас к пониманию этих процессов.

Литература:
Tyler J. Alban et al, Neoantigen immunogenicity landscapes and evolution of tumor ecosystems during immunotherapy with nivolumab, Nature Medicine (2024). DOI: 10.1038/s41591-024-03240-y