Ученые разработали революционный метод оценки иммунных клеток

Иммунная система онкологических пациентов сильно нарушена, и те, у кого в крови больше иммунных клеток, имеют лучшую выживаемость, как показало новое исследование. Институт Фрэнсиса Крика и Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе представили инновационный метод, позволяющий точно оценивать долю Т-клеток и В-клеток на основе данных полногеномного секвенирования (WGS).

Этот инструмент, названный ImmuneLENS, был опубликован в журнале Nature Genetics. Он использует образцы крови для создания полной записи ДНК человека, что позволяет ученым анализировать количество иммунных клеток и выявлять изменения в генах, влияющие на борьбу организма с болезнью. Это особенно важно для изучения генетических заболеваний, таких как рак.

Команда ученых проанализировала более 90 000 образцов WGS из проекта «100 000 геномов», проведенного Genomics England и NHS England. Они обнаружили, что у больных раком доля Т-клеток в крови ниже, чем у здоровых людей. Более высокие показатели Т-клеток коррелировали с уменьшением смертности от рака на 47% в течение пяти лет после операции. Этот эффект был значителен независимо от возраста, стадии рака и типа заболевания.

Профессор Николас Макгранахан, старший автор исследования, подчеркнул важность анализа иммунных клеток в крови.

«До сих пор большинство исследований иммунной системы были сосредоточены на самой опухоли. Результаты, которые мы видим с помощью ImmuneLENS, представляют значительный интерес», — отметил он.

ImmuneLENS позволяет сравнивать изменения иммунных клеток в крови с тем, что происходит в опухолевой среде. Это открывает новые возможности для изучения рака и других заболеваний.

«Знание того, имеет ли пациент относительно высокое или низкое количество иммунных клеток в крови, может помочь клиницистам принять правильное решение о лечении», — добавил профессор Макгранахан.

Рак вызывается генетическими мутациями в клетках организма. Иммунные клетки могут распознавать и устранять опасные мутации, но рак часто уклоняется от этой реакции и разрушает иммунную систему. Оценка изменений как в области вокруг опухоли, так и в иммунной системе в целом важна для понимания развития рака и прогнозирования реакции на лечение.

Крупномасштабные инициативы, такие как проект «100 000 геномов», позволили исследователям увидеть полный спектр генетических изменений как в здоровых, так и в раковых клетках. Однако точный состав иммунных клеток как в опухоли, так и в широком иммунном окружении оставался неизвестным.

ImmuneLENS основан на методе, разработанном в 2021 году, который позволяет рассчитывать долю Т-клеток на основе данных секвенирования всего экзома. Профессор Макгранахан отметил, что этот метод рассматривает «сам стог сена» и спрашивает, как присутствие иммунных клеток меняет его общую форму. Это позволяет найти «иголку» — ключевые иммунные клетки, связанные с выживаемостью при раке.

Доктор Роберт Бентам, первый автор исследования, подчеркнул, что ImmuneLENS позволяет идентифицировать различные типы В-клеток, которые специализируются на выработке определенных антител. Исследование показало, что В-клетки, продуцирующие антитела IgM/D, связаны с улучшением выживаемости онкологических больных. Это делает их многообещающим биомаркером для диагностики рака и разработки новых методов лечения.

Одним из следующих шагов будет использование этих биологических маркеров в клинической практике.

«Мы живем в золотой век исследований, когда можем использовать данные о пациентах для персонализации лечения», — отметил доктор Бентам.

Институт Фрэнсиса Крика и Калифорнийский университет продолжат работу над внедрением ImmuneLENS в клиническую практику. Это может стать важным инструментом для прогнозирования реакции пациентов на иммунотерапию и улучшения результатов лечения онкологических заболеваний.

Литература:
Robert Bentham etc al. ImmuneLENS characterizes systemic immune dysregulation in aging and cancer, Nature Genetics (2025). DOI: 10.1038/s41588-025-02086-5