В новом исследовании, опубликованном в журнале Genome Biology, ученые из Центра молекулярной медицины Макса Дельбрюка (Max Delbrück Center for Molecular Medicine) с помощью новой технологии обнаружили в опухолевых клетках общую для разных видов рака закономерность, состоящую из характерного сочетания генов. Авторы исследования также обнаружили типы генов в образце, которые никогда раньше не были напрямую связаны с раком.
Материалы и методы исследования
Чтобы надежно отличить раковые клетки от здоровых, ученые разработали новый алгоритм машинного обучения под названием «ikarus». Алгоритм использует обучающие данные путем поиска шаблонов.
Ученые использовали данные клеток рака легких и колоректального рака для обучения алгоритма, прежде чем применять его к наборам данных других видов опухолей. На этапе обучения ikarus должен был найти список характерных генов, которые затем использовались для категоризации клеток.
Результаты научной работы
После этапа обучения алгоритм смог надежно различать здоровые и опухолевые клетки и при других типах рака, например, в образцах тканей больных раком печени или нейробластомой. В первоначальных тестах ikarus уже продемонстрировал, что алгоритм также может отличать другие типы (и некоторые подтипы) клеток от опухолевых клеток. Таким образом, алгоритм ikarus позволяет идентифицировать гены, которые являются потенциальными факторами развития рака.
Авторы другого исследования утверждают, что искусственный интеллект помогает спрогнозировать риск инфаркта, анализируя голоса.
Руководитель Отдела организации клинических исследований, врач-онколог, уролог в АО «СЗЦДМ» (г. Санкт-Петербург), редактор и автор статей
