В новом исследовании, опубликованном в журнале Nature Medicine, ученые из Университета Техаса (University of Texas) разработали и подтвердили сигнатуру экспрессии генов, способную спрогнозировать выживаемость пациентов с перитонеальным карциноматозом (ПК) лучше, чем другие клинические признаки.
Два подтипа перитонеального карциноматоза
Исследователи из онкологического центра доктора медицины Андерсона Техасского университета, которые профилировали более 45000 отдельных клеток пациентов с перитонеальным карциноматозом (ПК), специфической формой метастатического рака желудка, определили обширную клеточную гетерогенность и определили два различных подтипа, коррелирующих с выживаемостью пациентов. Если сигнатура экспрессии генов будет подтверждена в проспективных исследованиях, эта технология может быть полезна для стратификации пациентов с раком желудка для более эффективных методов лечения.
Материалы и методы исследования
Для исследования ученые выделили клетки ПК из асцитной жидкости, взятой у 20 пациентов с запущенным раком желудка. После выполнения секвенирования РНК одной клетки для анализа экспрессии генов исследователи смогли построить первую «карту» клеток ПК, которая описывает разнообразие имеющихся типов клеток и их функциональные состояния.
Вариабельность раковых клеток, присутствующих в опухоли, известна как внутриопухолевая гетерогенность, и это может привести к неудаче лечения и рецидиву, поскольку различные подтипы раковых клеток будут по-разному реагировать на данную терапию. Информация об экспрессии генов также позволила исследователям определить происхождение клеток ПК, известных как линия опухолевых клеток.
Результаты научной работы
Ученые обнаружили, что многие клетки рака желудка происходили из желудка, однако некоторые из них происходили из клеток кишечника. Классифицируя опухолевые клетки на основе состава клонов, ученые отметили 2 группы пациентов. ПК-клетки, более похожие на желудок, имели агрессивный фенотип и были связаны плохой выживаемостью. Однако ПК-клетки, произошедшие из кишечника, были менее агрессивными, и пациенты имели более длительную выживаемость.
Основываясь на полученных результатах, исследователи разработали сигнатуру гена, которая лучше прогнозировала выживаемость пациентов, чем различные клинические признаки. Исследователи подтвердили сигнатуру во второй когорте пациентов с распространенным раком желудка в 4 когортах с крупномасштабным локализованным раком желудка, насчитывающих более 1300 пациентов.
Ученые намереваются провести дальнейший анализ ПК-клеток у большего числа пациентов, чтобы выявить регуляторные механизмы пластичности клонов опухолевых клеток и новые терапевтические цели, которые можно использовать для обеспечения лучших методов лечения для пациентов.
Авторы другого исследования обнаружили, что прием новых пероральных антикоагулянтов может привести к раку желудка.
Врач кардиолог, терапевт, врач функциональной диагностики АО «СЗЦДМ» (г. Санкт-Петербург), редактор и автор статей
