Изучение стоматологических секретов японских бактериальных геномов эпохи Эдо

Ваши зубы подобны крошечным капсулам времени — у них есть потенциал, чтобы предоставить ученым огромное количество информации в будущем. Например, если вы позволите своему зубному налету затвердеть в зубной камень, он может сохранить генетический материал вашего микробиома полости рта: бактерии, которые называют ваш рот домом.

Материалы и методы исследования

В новом исследовании, опубликованном в журнале Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, исследовательская группа из Токийского медицинского и стоматологического университета (Tokyo Medical and Dental University) исследовала зубы 12 человеческих скелетов из Японии эпохи Эдо (1603-1867), собранных в 1955 году с бывшего кладбища в Токио. 

Целью данного исследования было выявить признаки пародонтита (заболевание десен) у этих древних скелетов, проанализировать бактериальные геномы, сохранившиеся в зубном камне, и сравнить микробиомы полости рта эпохи Эдо с их эквивалентами в современных образцах.

Новизна исследования

Чтобы исследовать взаимосвязь между выявленными бактериями и пародонтитом, ученые разработали новый метод диагностики заболеваний пародонта у древних скелетов.

Автор исследования Такахико Шиба (Takahiko Shiba) объясняет: «Ранее зубы необходимо было бы извлекать из челюстной кости, чтобы определить длину корня и количественно оценить потерю костной массы как показатель заболеваний пародонта. Однако благодаря достижениям в технологии микрокомпьютерной томографии мы смогли точно количественно оценить потерю костной массы, не удаляя зубы из скелетов».

Результаты научной работы

Секвенирование 16S рДНК показало, что бактериальный состав Эдо и современных образцов с периодонтитом были разными. Интересно, что несколько бактерий, наблюдаемых в современных образцах, не были обнаружены в образцах Эдо. 

Неожиданно исследователи обнаружили заболевания пародонта у 5 из 12 скелетов эпохи Эдо (42%), таким образом, распространенность заболеваний десен среди людей в эпоху Эдо, по-видимому, была аналогична распространенности заболеваний десен в современную эпоху; в 2005 году было обнаружено, что 37,3% японцев в возрасте за сорок страдают заболеваниями десен. 

Однако, несмотря на это сходство в распространенности заболеваний пародонта, были также выявлены важные различия между бактериальными геномами древнего зубного камня и геномами современных японских образцов. Например, три вида бактерий, связанных с тяжелым заболеванием пародонта, не были обнаружены среди этих древних бактериальных геномов. Различные виды бактерий являются основными патогенами, ответственными за заболевания пародонта в Токио эпохи Эдо.

Обсуждение результатов исследования

«Эпоха Эдо в Японии известна своей строгой изоляционистской внешней политикой с очень небольшим взаимодействием между японцами и иностранцами. Эта политика нашла отражение в изученных нами микробиомах полости рта, которые отличались от современных и древних западных аналогов. Таким образом, наше исследование проливает новый свет на эволюцию микробиома полости рта и патогенез пародонта», — заключает автор исследования Хироаки Кобаяши (Hiroaki Kobayashi).

Авторы другого исследования выяснили, почему некоторые люди могут быть более склонны к тяжелой инфекции десен.