С помощью программного обеспечения ученые создают новые схемы лечения туберкулеза

В связи с нехваткой новых лекарственных средств против туберкулеза, находящихся в процессе разработки, программный инструмент из Университета Мичигана (University of Michigan) поможет спрогнозировать, каким образом современные препараты можно комбинировать для создания более эффективных методов лечения. Исследование было опубликовано в научном журнале mBio.

«Это может заменить нашу традиционную систему проб и ошибок для разработки лекарственного средства», — говорит Шрирам Чандрасекаран (Sriram Chandrasekaran).

Актуальность исследования

Туберкулез убивает 1,8 миллиона человек каждый год и является самой смертельной бактериальной инфекцией в мире. В настоящее время для лечения туберкулеза используется 28 препаратов, которые можно объединить в 24 000 комбинаций из трех или четырех препаратов. Если добавить еще пару новых препаратов, это увеличивает потенциальные комбинации до 32 000.

Ученые утверждают, что эти цифры делают разработку новых схем лечения трудоемкой и дорогостоящей. В то же время штаммы с множественной лекарственной устойчивостью распространяются очень быстро.

Материалы и методы исследования

Программное обеспечение, получившее название INDIGO, сокращение от INferring Drug Interactions, показало, что эффективность противотуберкулезных лекарственных средств может усиливаться, когда они объединяются с антипсихотиками или противомалярийными препаратами.

«Этот инструмент может точно спрогнозировать активность комбинаций лекарственных средств, включая синергизм, где активность комбинации больше, чем сумма отдельных препаратов», — говорит Шуи Ма (Shuyi Ma), ученый из Университета Вашингтона (University of Washington). «Программа также точно предсказывает антагонизм между лекарственными средствами, где активность комбинации меньше. Кроме того, он также идентифицирует гены, которые контролируют эти лекарственные реакции».

Результаты научного исследования

Среди комбинаций, которые INDIGO идентифицировал как демонстрирующие высокую вероятность эффективности против туберкулеза, были:

  1. Комбинация из пяти препаратов против туберкулеза: бедаквилин, клофазимин, рифампицин, кларитромицин с противомалярийным препаратом P218.
  2. Комбинация из четырех препаратов: бедаквилин, клофазимин, претоманид и антипсихотический препарат тиоридазин.
  3. Комбинация антибиотиков моксифлоксацина, спектиномицина — двух препаратов, которые обычно являются антагонистами, но могут стать синергетическими при добавлении третьего препарата, клофазимина.

Все три группировки находились в верхней части 0,01% синергетических комбинаций, определенных INDIGO.

«Успешные комбинации, выявленные INDIGO при тестировании в лабораторных условиях, показали синергизм в 88,8% случаев», — сказал Чандрасекаран.

Выводы

В то время, когда не хватает новых препаратов для борьбы со старыми, но развивающимися болезнями, этот инструмент представляет новый способ использования существующих инструментов медицины. Ответы могут быть уже там, и нестандартный подход INDIGO представляет собой более быстрый способ их поиска. INDIGO использует базу данных ранее опубликованных исследований, с разбивкой и количественной оценкой, наряду с подробной информацией о свойствах сотен лекарств.

Авторы другого исследования утверждают, что защитить от туберкулеза сможет новая вакцина в виде спрея.