Каждый скелет — это не только кость, но и часть живой истории. И когда из древних останков получается достать следы микробных генов, прошлое начинает разговаривать с нами напрямую. Именно такая история произошла с останками возрастом около 5 500 лет, найденными в скальном укрытии недалеко от нынешней Боготы.
Учёные сумели извлечь древний геном патогена, связанного с сифилисом и родственными заболеваниями, что радикально расширило представление об эволюции этих инфекций — на тысячи лет раньше, чем считалось возможным.
Где и что нашли
Останки были найдены на археологическом памятнике Tequendama 1 в Колумбии. Для исследования использовали самые современные методы палеогеномики: обычные признаки инфекции на костях отсутствовали, но глубокий анализ древней ДНК выявил следы Treponema pallidum — бактерии, известной как возбудитель сифилиса и родственных трепонемных заболеваний.
Это позволило отодвинуть «чёрную дату» появления трепонемных инфекции на более чем 3 000 лет назад, в глубокую древность.
Как отмечает генетик Ларс Ферен-Шмитц (Lars Fehren-Schmitz) из Университета Калифорнии в Санта-Крузе (University of California, Santa Cruz), такие открытия показывают, насколько велики возможности палеогеномики — науки, которая позволяет буквально читать зашифрованные в костях страницы эволюционной истории.
Что такое трепонемные инфекции
Treponema pallidum — это спиралевидная бактерия, разделяющаяся на несколько близких подвидов, каждый из которых вызывает разные клинические заболевания:
- сифилис,
- фрамбезию (yaws),
- беджель.
Четвёртое заболевание этой группы — пинта — вызывается Treponema carateum или разновидностью T. pallidum subsp. carateum. Полный геном последнего до сих пор не был получен учёными, что оставляло большие пробелы в понимании эволюции всех трепонемных болезней.
Несмотря на то что у всех этих бактерий генетическая структура очень похожа, они циркулируют в разных географических зонах и по-разному проявляются у людей, что усложняет реконструкцию их истории.
Древняя ветвь знакомого патогена
Генетический материал, извлечённый из древнего скелета, принадлежал Treponema pallidum, но не совпадал ни с одним из известных сегодня подвидов. В генетическом древе эта линия расположилась особенно глубоко: она отделилась от общей ветви примерно 13 700 лет назад, задолго до того, как появились современные формы болезни, выделившиеся около 6 000 лет назад.
Это означает, что разнообразие трепонемных инфекций было уже развито в далёком прошлом и их эволюция началась гораздо раньше, чем показывали предыдущие находки.
Как подчёркивает Элизабет Нельсон (Elizabeth Nelson), молекулярный антрополог и палеопатолог из Южного методистского университета (Southern Methodist University), такие данные проливают новый свет на то, как долго инфекции сопровождали человечество.
Случайная находка в массовом наборе ДНК
Патоген обнаружили не целенаправленно, а в процессе анализа человеческой ДНК. Учёные из Университета Калифорнии в Санта-Крузе и Университета Лозанны независимо заметили следы Treponema в результате глубокой секвенции: около 1,5 млрд фрагментов генетического материала. Хотя бактериальная ДНК составляла лишь малую часть, высокая плотность данных позволила реконструировать полный геном.
Особенно важно, что у кости — большеберцовой — не было видимых следов инфекции. Это означает, что древняя ДНК может сохраняться даже в тех образцах, где её не ждёшь, и что археологические находки могут скрывать гораздо больше информации, чем кажется на первый взгляд.
Почему это важно сегодня
Понимание древней истории болезней имеет непосредственное значение для современных исследований инфекций: эволюционные корни показывают пути адаптации, возможные механизмы уклонения от иммунитета и объясняют, почему одни штаммы вызывают тяжёлые болезни, а другие — нет. Такие данные помогают предугадывать, как инфекции могут эволюционировать в будущем.
Перед публикацией результатов команда учёных провела консультации с научным сообществом и местными сообществами в Колумбии, подчёркивая этичный подход к изучению и интерпретации археологических находок.
Заключение: древний микроб и его следы в истории болезни
Это открытие расширяет наше понимание времени и места, где жили трепонемные инфекции, и показывает, что даже те микробы, которые мы ассоциируем с болезнями современной эпохи, имели длинную эволюционную историю, уходящую в глубокую древность. Такие находки помогают лучше понять механизмы взаимодействия патогенов с людьми и дают ключ к реконструкции истории болезней.
Похожую роль в реконструкции эволюции трепонемных патогенов играет анализ их стратегий избегания иммунных атак — о чём подробно рассказывается в материале «Сифилис избегает иммунной атаки путём изменения одного гена», где рассматриваются современные механизмы выживания бактерий и их влияние на клиническое течение болезни.
Источник
- Davide Bozzi, Nasreen Z. Broomandkhoshbacht, Miguel Delgado, Jane E. Buikstra, Carlos Eduardo G. Amorim, Kalina Kassadjikova, Melissa Pratt Estrada, Gilbert Greub, Nicolas Rascovan, David Šmajs, Lars Fehren-Schmitz, Anna-Sapfo Malaspinas, Elizabeth A. Nelson. A 5500-year-old Treponema pallidum genome from Sabana de Bogotá, Colombia. Science, 2026; 391 (6783) DOI: 10.1126/science.adw3020
Ведущий специалист отдела организации клинических исследований, терапевт, врач ультразвуковой диагностики ООО «ВеронаМед» (г. Санкт-Петербург), главный редактор, учредитель сетевого издания Medical Insider, а также автор статей.
E-mail для связи – xuslan@yandex.ru;
