Анализ кишечных бактерий по калу выявил до 90% случаев колоректального рака

Колоректальный рак остаётся одной из ведущих причин смерти от онкологических заболеваний в мире, и главная проблема здесь стара как сама онкология: опухоль слишком часто находят поздно. На этом фоне особенно важны методы, которые позволяют выявлять болезнь раньше и без тяжёлых для пациента процедур. Исследователи Университета Женевы (University of Geneva, UNIGE) представили подход, который использует анализ кишечной микробиоты в образцах кала и с высокой точностью распознаёт колоректальный рак. Работа опубликована в журнале Cell Host & Microbe.

Почему понадобился новый подход

Колоноскопия по-прежнему считается основным методом скрининга, но она требует подготовки, стоит недёшево и многими пациентами переносится тяжело. Именно поэтому часть людей откладывает обследование, а некоторые вообще его избегают. Между тем при раннем выявлении колоректальный рак часто хорошо поддаётся лечению. Авторы новой работы исходили из простой мысли: если кишечная микробиота действительно меняется при опухоли, значит, эти изменения можно использовать как неинвазивный диагностический сигнал.

В чём была основная идея исследования

Проблема прежних микробиомных подходов в том, что анализ на уровне вида бактерий слишком грубый, а анализ на уровне отдельных штаммов, наоборот, слишком «шумный» и плохо переносится между разными людьми и популяциями. Команда под руководством Мирко Трайковски (Mirko Trajkovski) предложила промежуточный уровень — подвиды бактерий, или subspecies. Именно для этого исследователи сначала создали подробный каталог подвидов человеческой кишечной микробиоты, а затем научились использовать его для клинического анализа.

Что показали результаты

Когда этот каталог объединили с уже существующими клиническими наборами данных, получилась модель, способная выявлять колоректальный рак по образцам кала с чувствительностью около 90%. Для сравнения, в пресс-материале авторы указывают, что колоноскопия достигает примерно 94%, а полученный ими результат оказался лучше, чем у существующих неинвазивных методов обнаружения. Это не означает, что колоноскопия завтра исчезнет из практики. Но как инструмент первичного скрининга такой тест выглядит очень серьёзно.

Именно здесь работа становится особенно интересной. Исследователи не просто нашли «несколько плохих бактерий», которые связаны с опухолью. Они показали, что клинически значимая информация скрыта глубже — на уровне функционально отличающихся подгрупп внутри одного и того же бактериального вида. Проще говоря, две бактерии с одинаковым «видовым паспортом» могут вести себя по-разному, и для диагностики это критично.

Почему подвиды бактерий важнее, чем просто виды

Авторы подчёркивают, что отдельные штаммы внутри одного вида могут иметь разный набор генов и разную биологическую роль. Одни способны участвовать в процессах, связанных с опухолевым ростом, другие — нет. Поэтому анализ только на уровне видов часто стирает эти различия. Подвидовой уровень, который использовала команда из Женевы, оказался достаточно чувствительным, чтобы уловить функциональные различия, и одновременно достаточно устойчивым, чтобы работать на разных выборках.

Что это может изменить в клинической практике

Исследователи уже готовят клиническое испытание совместно с Женевскими университетскими больницами, чтобы точнее понять, какие стадии опухоли и какие предраковые изменения способен распознавать этот метод. Если результаты подтвердятся, такой анализ кала можно будет использовать как первый этап скрининга, а колоноскопию — оставлять для подтверждения положительных случаев и дальнейшей тактики. Это выглядело бы логично: дешёвый и неинвазивный тест для массового отбора, а инвазивная процедура — только там, где она действительно нужна.

Почему значение работы выходит за рамки рака кишечника

Авторы прямо пишут, что созданный ими подвидовой каталог может пригодиться далеко не только для колоректального рака. Если микробиота действительно содержит диагностическую информацию на этом уровне, аналогичный подход теоретически можно использовать и для других заболеваний. То есть речь идёт не просто о тесте на одну опухоль, а о платформе, которая может расширить саму идею неинвазивной диагностики по микробиому. Это ещё не готовая универсальная технология, но направление очень сильное.

Авторы другого исследования ранее показали, что кишечные бактерии могут не только сопровождать опухоль, но и влиять на эффективность противоопухолевого лечения — подробнее об этом можно прочитать в материале «Кишечные бактерии могут повышать эффективность иммунотерапии рака».

Заключение

Новая работа Университета Женевы (University of Geneva, UNIGE) показывает, что анализ кишечной микробиоты по образцу кала может стать реальным инструментом раннего выявления колоректального рака. Ключевым оказался не просто состав бактерий, а их подвидовая организация — тот уровень, который раньше почти не использовался в клинической диагностике. До замены колоноскопии ещё далеко, но идея неинвазивного теста с точностью, близкой к эндоскопии, уже перестала выглядеть фантазией.

Литература

Tričković M., Kieser S., Zdobnov E.M., Trajkovski M. Subspecies of the human gut microbiota carry implicit information for in-depth microbiome research // Cell Host & Microbe. 2025. Vol. 33, No. 8. P. 1446–1458.e4. doi:10.1016/j.chom.2025.07.015.