Исследователи из Онкологического центра имени М. Д. Андерсона Техасского университета (The University of Texas MD Anderson Cancer Center) подробно изучили опухолевое микроокружение при раннем трижды негативном раке молочной железы и выявили иммунные признаки, связанные с ответом на химиотерапию.
Опухолевое микроокружение — это не только сами раковые клетки, но и окружающие их иммунные, соединительнотканные и другие клетки, которые могут либо сдерживать опухоль, либо помогать ей выживать. В новой работе особое внимание привлекли макрофаги — клетки иммунной системы, которые обычно участвуют в «уборке» повреждённых тканей и защите от инфекций, но при раке могут вести себя по-разному.
Исследование опубликовано в журнале Nature. Его возглавили Николас Навин (Nicholas Navin), руководитель направления системной биологии, и Клинтон Ям (Clinton Yam), врач и научный сотрудник отделения лекарственного лечения рака молочной железы.
Почему трижды негативный рак молочной железы трудно лечить
Трижды негативный рак молочной железы — агрессивный подтип опухоли, при котором в клетках обычно нет трёх ключевых мишеней: рецепторов эстрогена, рецепторов прогестерона и повышенного количества рецептора человеческого эпидермального фактора роста 2 (HER2). Из-за этого многие гормональные и таргетные, то есть направленные на конкретную молекулярную мишень, методы лечения здесь не подходят.
Часто таким пациенткам назначают химиотерапию. Однако ответ на неё может сильно различаться: у одних опухоль заметно уменьшается, у других лечение оказывается менее эффективным. Поэтому врачам нужны способы заранее понять, у кого вероятность хорошего ответа выше.
Что сделали исследователи
Учёные изучили образцы опухоли, полученные до начала химиотерапии, у пациенток с трижды негативным раком молочной железы. Они провели одноклеточный анализ более 427 000 клеток от 101 пациентки. Одноклеточный анализ позволяет рассматривать не «усреднённую» опухоль, а отдельные клетки внутри неё — так можно увидеть редкие, но важные клеточные состояния.
Также исследователи использовали пространственную транскриптомику опухолей от 44 пациенток. Этот метод показывает, какие гены активны в разных участках ткани и как клетки расположены по отношению друг к другу.
Полученные данные сравнили с профилями нормальной ткани молочной железы из Атласа клеток молочной железы человека (Human Breast Cell Atlas), который служит справочной картой типов и состояний клеток в здоровой ткани.
Четыре типа опухолей и 13 генов
На основе активности генов в раковых клетках исследователи разделили опухоли на четыре крупные группы, или «архетипа». Это означает, что даже внутри одного диагноза — трижды негативного рака молочной железы — опухоли могут заметно отличаться по своей биологии.
Учёные также выделили набор из 13 генов, активность которых была особенно характерна для опухолевых клеток. Такой набор называют транскрипционной сигнатурой: по сути, это молекулярный «почерк» опухоли, который может отражать её поведение и чувствительность к лечению.
На основе этой сигнатуры исследователи разработали панель из 13 генов и модель машинного обучения. Машинное обучение — это метод анализа данных, при котором компьютерная модель ищет закономерности в больших наборах информации. В данном случае цель состоит в том, чтобы предсказывать, какие пациентки с большей вероятностью ответят на химиотерапию.
Макрофаги оказались важнее, чем ожидалось
Ранее многие исследования опухолевого иммунитета сосредотачивались прежде всего на Т-клетках — иммунных клетках, которые могут распознавать и уничтожать опухолевые клетки. Новая работа показала, что при трижды негативном раке молочной железы важную роль могут играть и определённые подтипы макрофагов.
Авторы описали 49 состояний иммунных клеток и восемь устойчивых типов клеточных «соседств» внутри опухолевого микроокружения. Некоторые из этих состояний и соседств были связаны с лучшим ответом на неоадъювантную химиотерапию — лечение, которое проводят до операции, чтобы уменьшить опухоль и повысить шансы на успешное хирургическое вмешательство.
По словам Николаса Навина (Nicholas Navin), работа даёт новое представление о программах активности генов и разных состояниях клеток опухолевого микроокружения при трижды негативном раке молочной железы. Особенно важным он назвал выявление программ и подтипов макрофагов, связанных с хорошим ответом на химиотерапию.
Что это может изменить для пациенток
Пока результаты не означают, что новый тест уже готов для клинической практики. Для этого нужны дальнейшие перспективные исследования, то есть работы, в которых метод будут заранее проверять у новых пациенток и оценивать, насколько точно он предсказывает результат лечения.
Тем не менее исследование может стать основой для более точной диагностики и индивидуального подбора терапии. Если такие подходы подтвердятся, врачи смогут лучше понимать, кому химиотерапия с высокой вероятностью поможет, а кому может понадобиться другая или усиленная лечебная стратегия.
Клинтон Ям (Clinton Yam) отметил, что полученные данные помогают объяснить, почему разные опухоли по-разному реагируют на химиотерапию, и могут в будущем способствовать более индивидуальному лечению пациенток с трижды негативным раком молочной железы.
Ранее исследователи также изучали другие уязвимости этого подтипа опухолей: например, сообщалось, что трижды негативный рак молочной железы может использовать гликоген для выживания и роста.
Литература
Yan Y. et al. Ecotypes of triple-negative breast cancer in response to chemotherapy // Nature. — 2026. — DOI: 10.1038/s41586-026-10469-9.