Для создания персонализированной иммунотерапии рака обычно требуется образец опухолевой ткани. Новое исследование показало, что значительную часть необходимой информации можно получить из обычного образца крови: циркулирующая опухолевая ДНК позволила обнаружить опухолевые неоантигены, а иммунные клетки крови — Т-лимфоциты, способные их распознавать. У многих пациентов результаты в значительной степени совпадали с данными традиционной биопсии опухоли.
Исследование опубликовано в журнале Cancer Discovery Американской ассоциации исследований рака. Работу возглавила Алена Грос (Alena Gros), руководитель группы иммунологии опухолей и иммунотерапии Института онкологии Vall d’Hebron (Vall d’Hebron Institute of Oncology, VHIO) в Испании. Первым автором стала Андреа Гарсия-Гарихо (Andrea Garcia-Garijo), научный сотрудник группы Грос.
Неоантигены помогают иммунитету отличать опухоль от здоровых клеток
По мере развития рака в опухолевых клетках накапливаются мутации. Некоторые из них приводят к появлению измененных белков, фрагменты которых иммунная система может распознавать как чужеродные. Такие молекулы называют неоантигенами.
Их особенность заключается в том, что они образуются в опухоли и отсутствуют в нормальных клетках организма. Благодаря этому неоантигены рассматриваются как перспективные мишени для персонализированной иммунотерапии.
На их основе разрабатываются индивидуальные противоопухолевые вакцины и Т-клеточные методы лечения. Ранее на Medical Insider рассказывалось о персонализированной мРНК-вакцине, направленной против опухолевых неоантигенов при раке поджелудочной железы.
Но прежде чем создать такое лечение, необходимо определить, какие именно неоантигены присутствуют у конкретного пациента и существуют ли Т-лимфоциты, способные их распознавать.
Обычно для этого требуется биопсия или хирургически удаленная опухолевая ткань.
Проблема заключается в том, что получить такой материал удается не всегда. Некоторые опухоли располагаются в труднодоступных местах, а состояние пациента может не позволять провести дополнительную инвазивную процедуру.
Исследователи попробовали получить ту же информацию из крови
Команда Алены Грос решила выяснить, можно ли отказаться от обязательного использования опухолевой ткани и получить необходимые данные исключительно из периферической крови.
Для поиска мутаций исследователи использовали циркулирующую опухолевую ДНК (цДНК опухоли, ctDNA) — фрагменты генетического материала, которые опухолевые клетки выделяют в кровоток.
Если секвенировать такую ДНК, можно обнаружить часть мутаций, присутствующих в опухоли, а затем определить потенциальные неоантигены.
Параллельно исследователи анализировали Т-лимфоциты из той же крови, чтобы установить, существуют ли иммунные клетки, способные распознавать выявленные опухолевые мишени.
Таким образом, один образец крови потенциально мог дать информацию сразу о двух ключевых компонентах персонализированной терапии: опухолевых неоантигенах и направленных против них Т-клетках.
Анализ крови обнаружил большинство мишеней, найденных при биопсии
Первоначально в исследование включили восемь пациентов с метастатическими солидными опухолями, включая меланому, рак молочной железы, опухоли головы и шеи и колоректальный рак.
У шести из восьми пациентов исследователям удалось выделить достаточное количество циркулирующей опухолевой ДНК для анализа.
Затем результаты сравнили с данными секвенирования опухолевой ткани тех же пациентов.
Оказалось, что анализ циркулирующей опухолевой ДНК выявлял от 63,25% до 97,4% неоантигенов, которые были обнаружены традиционным исследованием опухолевой ткани.
Это означает, что по крайней мере у части пациентов анализ крови способен воспроизвести значительную долю информации