Одни и те же кишечные бактерии, но разные гены: у 10 тысяч человек «мелкие опечатки» в ДНК микробов связали с возрастом, давлением и холестерином

4 ноября 2026 года в журнале Nature опубликовано исследование под руководством Университетского медицинского центра Гронингена: проанализировав образцы кала 10 781 человека из шести когорт в Нидерландах и Танзании, учёные нашли сотни устойчивых связей между мелкими генетическими различиями внутри одних и тех же видов кишечных бактерий и характеристиками людей — прежде всего возрастом, а также давлением, индексом массы тела, холестерином и питанием. Это наблюдательная работа на людях; она описывает связи и не доказывает, что эти варианты бактерий влияют на здоровье.

Что важно понять сразу: два человека могут носить в кишечнике одни и те же виды бактерий, но их «версии» отличаются, как разные издания одной книги с опечатками. Исследование показывает, что эти отличия могут нести информацию о человеке, которую не видно при обычном подсчёте видов. Практических тестов или советов на основе этой работы пока нет.

Работу возглавили исследователи Университетского медицинского центра Гронингена (Universitair Medisch Centrum Groningen) в Нидерландах вместе с коллегами из Италии, Танзании, США, Румынии и Германии. Статья вышла в Nature.

Почему мало знать «кто живёт в кишечнике»

Большинство исследований микробиома отвечает на вопрос, каких бактерий у человека больше, а каких меньше. Но внутри одного вида бактерии генетически очень разнообразны. Небольшие замены отдельных «букв» ДНК — их называют однонуклеотидными вариантами — могут менять белки бактерий, а значит, то, что они умеют делать: какие вещества расщепляют, что выделяют, как взаимодействуют с иммунитетом.

Раньше отдельные варианты бактериальных генов уже связывали с воспалительными заболеваниями кишечника, раком желудка, диабетом 2 типа. Но систематически проверить связь таких вариантов с широким набором характеристик человека до сих пор почти не пытались.

Как проводили исследование

Учёные использовали данные 11 831 образца кала от 10 781 человека из шести независимых проектов: пять в Нидерландах, включая большую голландскую когорту Lifelines, и один в Танзании. По каждому человеку было известно 244 характеристики: от возраста, давления и анализов крови до питания, лекарств и условий жизни.

В ДНК бактерий нашли около 12,7 миллиона распространённых вариантов в 433 видах, которые в среднем составляли более 80% кишечного сообщества. Затем исследователи проверили, связан ли каждый вариант с каждой характеристикой человека, учитывая возраст, пол и численность самих бактерий. Связь считали надёжной, только если она повторялась хотя бы в двух независимых когортах.

Что нашли

Итог — 940 независимых сигналов, связывающих варианты бактерий 101 вида с 69 характеристиками людей. Примерно две трети этих сигналов не были связаны с тем, сколько бактерий данного вида у человека. То есть генетика микробов давала информацию, которую обычный анализ «кого сколько» пропустил бы.

Больше всего связей оказалось с возрастом. Модель машинного обучения, которой показывали только генетические варианты бактерий, могла заметно, хотя далеко не точно, предсказывать возраст человека. Один пример: у бактерии Faecalibacterium prausnitzii, которую обычно считают «полезной», нашли варианты гена транспортного белка, связанные с возрастом. Люди, у которых в кале встречалась эта версия гена, были в среднем почти на пять лет старше. Компьютерное моделирование предположило, что изменённый участок белка может связывать глутатион — антиоксидант. Но эту функцию в лаборатории не проверяли, и неизвестно, влияет ли вариант на старение или просто сопутствует ему.

Связи нашли и с сердечно-сосудистыми и обменными показателями: давлением, индексом массы тела, холестерином, триглицеридами, желчными кислотами, показателями крови, а также с особенностями питания. Все результаты авторы выложили в открытый онлайн-каталог для других исследователей.

Ограничения

Это анализ связей, а не экспериментов. Из него нельзя сделать вывод, что конкретная версия бактерии повышает давление или «старит» человека. Возможна и обратная зависимость: возраст, питание или лекарства меняют условия в кишечнике, и в них выживают другие варианты бактерий. Большинство участников — жители Нидерландов, поэтому для других стран с иным питанием картина может отличаться. Предсказание возраста по бактериям — исследовательский инструмент, а не способ определить «биологический возраст» конкретного человека.

Что это значит для вас

  • Пока это фундаментальное знание: оно не даёт новых анализов или диет «под свои бактерии».
  • Коммерческие тесты, обещающие по микробиому рассчитать биологический возраст или подобрать персональные добавки, на такие данные опираться пока не могут.
  • Для кишечника по-прежнему работают проверенные вещи: разнообразное питание с клетчаткой, физическая активность, разумное использование антибиотиков.

Ранее на mkb11.ru мы рассказывали, как внутри одного вида кишечных бактерий нашли разные «линии», связанные с возрастом и болезнями кишечника.

А вы когда-нибудь сдавали анализ на микробиом — помог ли он вам что-то изменить?

Литература

Терапевт, врач ультразвуковой диагностики, врач клинических исследований. Автор статей. Проверяет медицинскую точность материалов.

Принимает взрослых и детей в клинике «ВеронаМед», Санкт-Петербург. Выполняет УЗИ органов и сосудов, эхокардиографию.

E-mail для связи – xuslan@yandex.ru;

ПроДокторов;

НаПоправку

Medical Insider